MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia sp. CCGE1002 chromosome 3

Total Repeats: 26729

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014119	CGG	2	6	42	47	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295680426
2	NC_014119	CA	3	6	55	60	50 %	0 %	0 %	50 %	295680426
3	NC_014119	GCG	2	6	99	104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295680426
4	NC_014119	ATGC	2	8	116	123	25 %	25 %	25 %	25 %	295680426
5	NC_014119	CGCGTT	2	12	136	147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295680426
6	NC_014119	CG	3	6	198	203	0 %	0 %	50 %	50 %	295680426
7	NC_014119	TGC	2	6	217	222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295680426
8	NC_014119	GC	4	8	221	228	0 %	0 %	50 %	50 %	295680426
9	NC_014119	CG	4	8	229	236	0 %	0 %	50 %	50 %	295680426
10	NC_014119	GAT	2	6	259	264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295680426
11	NC_014119	GCT	2	6	316	321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295680426
12	NC_014119	GTCG	2	8	405	412	0 %	25 %	50 %	25 %	295680427
13	NC_014119	CG	3	6	418	423	0 %	0 %	50 %	50 %	295680427
14	NC_014119	TCG	2	6	458	463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295680427
15	NC_014119	GCG	2	6	513	518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295680427
16	NC_014119	CG	3	6	524	529	0 %	0 %	50 %	50 %	295680427
17	NC_014119	GGCGC	2	10	536	545	0 %	0 %	60 %	40 %	295680427
18	NC_014119	CTG	2	6	565	570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295680427
19	NC_014119	CGG	2	6	579	584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295680427
20	NC_014119	GC	3	6	590	595	0 %	0 %	50 %	50 %	295680427
21	NC_014119	CGC	2	6	614	619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295680427
22	NC_014119	GC	3	6	635	640	0 %	0 %	50 %	50 %	295680427
23	NC_014119	GCA	2	6	660	665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295680427
24	NC_014119	GAT	2	6	672	677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295680427
25	NC_014119	CGGG	2	8	762	769	0 %	0 %	75 %	25 %	295680427
26	NC_014119	GC	3	6	774	779	0 %	0 %	50 %	50 %	295680427
27	NC_014119	CG	3	6	789	794	0 %	0 %	50 %	50 %	295680427
28	NC_014119	GC	3	6	812	817	0 %	0 %	50 %	50 %	295680427
29	NC_014119	TCG	2	6	821	826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295680427
30	NC_014119	GTT	2	6	873	878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295680427
31	NC_014119	CGC	2	6	882	887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295680427
32	NC_014119	CATC	2	8	895	902	25 %	25 %	0 %	50 %	295680427
33	NC_014119	GCA	2	6	915	920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295680427
34	NC_014119	GCT	2	6	942	947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295680427
35	NC_014119	TGG	2	6	952	957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295680427
36	NC_014119	GC	4	8	974	981	0 %	0 %	50 %	50 %	295680427
37	NC_014119	CGG	2	6	990	995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295680427
38	NC_014119	ACG	2	6	1018	1023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295680427
39	NC_014119	GC	3	6	1046	1051	0 %	0 %	50 %	50 %	295680427
40	NC_014119	CGT	2	6	1082	1087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295680427
41	NC_014119	GCG	2	6	1102	1107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295680427
42	NC_014119	GC	3	6	1166	1171	0 %	0 %	50 %	50 %	295680427
43	NC_014119	CGG	2	6	1185	1190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295680427
44	NC_014119	GCT	2	6	1191	1196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295680427
45	NC_014119	CGTCG	2	10	1197	1206	0 %	20 %	40 %	40 %	295680427
46	NC_014119	GCTG	2	8	1208	1215	0 %	25 %	50 %	25 %	295680427
47	NC_014119	CG	3	6	1219	1224	0 %	0 %	50 %	50 %	295680427
48	NC_014119	GC	3	6	1274	1279	0 %	0 %	50 %	50 %	295680427
49	NC_014119	GAT	2	6	1280	1285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295680427
50	NC_014119	GGT	2	6	1298	1303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295680428
51	NC_014119	GCG	4	12	1308	1319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295680428
52	NC_014119	GCT	2	6	1346	1351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295680428
53	NC_014119	GCG	2	6	1366	1371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295680428
54	NC_014119	GCG	2	6	1392	1397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295680428
55	NC_014119	GCG	2	6	1423	1428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295680428
56	NC_014119	GCC	2	6	1479	1484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295680428
57	NC_014119	CGC	2	6	1507	1512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295680428
58	NC_014119	GGC	2	6	1515	1520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295680428
59	NC_014119	GC	3	6	1519	1524	0 %	0 %	50 %	50 %	295680428
60	NC_014119	CGGG	2	8	1531	1538	0 %	0 %	75 %	25 %	295680428
61	NC_014119	GC	4	8	1634	1641	0 %	0 %	50 %	50 %	295680428
62	NC_014119	CGG	2	6	1661	1666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295680428
63	NC_014119	CGA	2	6	1715	1720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295680428
64	NC_014119	TGC	2	6	1747	1752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295680428
65	NC_014119	CGC	2	6	1780	1785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295680428
66	NC_014119	GCGCT	2	10	1821	1830	0 %	20 %	40 %	40 %	295680428
67	NC_014119	GCG	2	6	1933	1938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295680428
68	NC_014119	CGC	2	6	1948	1953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295680428
69	NC_014119	GTC	2	6	1988	1993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295680428
70	NC_014119	TGG	2	6	2005	2010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295680428
71	NC_014119	GCG	2	6	2011	2016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295680428
72	NC_014119	CCG	2	6	2080	2085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295680428
73	NC_014119	CGT	2	6	2126	2131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295680428
74	NC_014119	GCA	2	6	2140	2145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295680428
75	NC_014119	CTGA	2	8	2178	2185	25 %	25 %	25 %	25 %	295680428
76	NC_014119	GCCC	2	8	2225	2232	0 %	0 %	25 %	75 %	295680428
77	NC_014119	AGC	2	6	2233	2238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295680428
78	NC_014119	GCG	2	6	2257	2262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295680428
79	NC_014119	CG	3	6	2270	2275	0 %	0 %	50 %	50 %	295680428
80	NC_014119	CG	3	6	2358	2363	0 %	0 %	50 %	50 %	295680428
81	NC_014119	GACG	2	8	2364	2371	25 %	0 %	50 %	25 %	295680428
82	NC_014119	GCT	2	6	2447	2452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295680428
83	NC_014119	GGC	2	6	2460	2465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295680428
84	NC_014119	CGA	2	6	2473	2478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295680428
85	NC_014119	CGC	2	6	2491	2496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295680428
86	NC_014119	CGA	2	6	2518	2523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295680428
87	NC_014119	CAA	2	6	2579	2584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295680428
88	NC_014119	ACG	2	6	2605	2610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295680428
89	NC_014119	ATC	2	6	2661	2666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295680429
90	NC_014119	AAC	2	6	2795	2800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295680429
91	NC_014119	CG	3	6	2833	2838	0 %	0 %	50 %	50 %	295680429
92	NC_014119	GCC	2	6	2856	2861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295680429
93	NC_014119	GC	3	6	2960	2965	0 %	0 %	50 %	50 %	295680429
94	NC_014119	ACG	2	6	2999	3004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295680429
95	NC_014119	GC	3	6	3042	3047	0 %	0 %	50 %	50 %	295680429
96	NC_014119	CG	3	6	3048	3053	0 %	0 %	50 %	50 %	295680429
97	NC_014119	CG	3	6	3091	3096	0 %	0 %	50 %	50 %	295680429
98	NC_014119	CG	3	6	3134	3139	0 %	0 %	50 %	50 %	295680429
99	NC_014119	CGC	2	6	3219	3224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295680429
100	NC_014119	TCAG	2	8	3266	3273	25 %	25 %	25 %	25 %	295680429
101	NC_014119	GTTCGC	2	12	3351	3362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295680429
102	NC_014119	TCA	2	6	3411	3416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295680429
103	NC_014119	GC	3	6	3494	3499	0 %	0 %	50 %	50 %	295680430
104	NC_014119	GC	3	6	3517	3522	0 %	0 %	50 %	50 %	295680430
105	NC_014119	TCA	2	6	3529	3534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295680430
106	NC_014119	GC	3	6	3542	3547	0 %	0 %	50 %	50 %	295680430
107	NC_014119	GCCG	2	8	3648	3655	0 %	0 %	50 %	50 %	295680430
108	NC_014119	CAAC	2	8	3674	3681	50 %	0 %	0 %	50 %	295680430
109	NC_014119	GAT	2	6	3738	3743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295680430
110	NC_014119	ACG	2	6	3823	3828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295680430
111	NC_014119	CGA	2	6	3833	3838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295680430
112	NC_014119	ACG	2	6	3932	3937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295680430
113	NC_014119	CGG	2	6	3941	3946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295680430
114	NC_014119	GTG	2	6	3952	3957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295680430
115	NC_014119	CGC	2	6	3984	3989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295680430
116	NC_014119	GAC	2	6	3996	4001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295680430
117	NC_014119	TCG	2	6	4007	4012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295680430
118	NC_014119	GC	3	6	4031	4036	0 %	0 %	50 %	50 %	295680430
119	NC_014119	GCC	2	6	4045	4050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295680430
120	NC_014119	GCG	2	6	4076	4081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295680430
121	NC_014119	CCGCA	2	10	4104	4113	20 %	0 %	20 %	60 %	295680430
122	NC_014119	GCG	2	6	4148	4153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295680430
123	NC_014119	CGC	3	9	4164	4172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295680430
124	NC_014119	CGA	3	9	4178	4186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295680430
125	NC_014119	AGC	2	6	4204	4209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295680430
126	NC_014119	CGG	2	6	4241	4246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295680430
127	NC_014119	TCGA	2	8	4320	4327	25 %	25 %	25 %	25 %	295680430
128	NC_014119	GATCGA	2	12	4346	4357	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	295680430
129	NC_014119	TCG	2	6	4372	4377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295680430
130	NC_014119	CGC	2	6	4401	4406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295680430
131	NC_014119	CG	3	6	4418	4423	0 %	0 %	50 %	50 %	295680430
132	NC_014119	TCGCGC	2	12	4426	4437	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	295680430
133	NC_014119	CG	3	6	4500	4505	0 %	0 %	50 %	50 %	295680430
134	NC_014119	ATCG	2	8	4530	4537	25 %	25 %	25 %	25 %	295680430
135	NC_014119	CAT	2	6	4560	4565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295680430
136	NC_014119	CGA	2	6	4592	4597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295680430
137	NC_014119	TCG	3	9	4606	4614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295680430
138	NC_014119	ATC	2	6	4618	4623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295680430
139	NC_014119	CAG	2	6	4677	4682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295680430
140	NC_014119	CCT	2	6	4706	4711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	295680430
141	NC_014119	GC	3	6	4728	4733	0 %	0 %	50 %	50 %	295680430
142	NC_014119	CAGC	2	8	4761	4768	25 %	0 %	25 %	50 %	295680430
143	NC_014119	ACG	2	6	4786	4791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295680430
144	NC_014119	CG	3	6	4816	4821	0 %	0 %	50 %	50 %	295680430
145	NC_014119	GCGCC	2	10	4835	4844	0 %	0 %	40 %	60 %	295680430
146	NC_014119	TGC	2	6	4883	4888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295680430
147	NC_014119	GC	3	6	4890	4895	0 %	0 %	50 %	50 %	295680430
148	NC_014119	CG	3	6	4897	4902	0 %	0 %	50 %	50 %	295680430
149	NC_014119	TGC	2	6	4930	4935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295680430
150	NC_014119	CGC	2	6	5003	5008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295680430
151	NC_014119	CGG	2	6	5013	5018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295680430
152	NC_014119	CGG	2	6	5034	5039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295680430
153	NC_014119	GC	3	6	5048	5053	0 %	0 %	50 %	50 %	295680430
154	NC_014119	CG	3	6	5076	5081	0 %	0 %	50 %	50 %	295680430
155	NC_014119	CG	4	8	5093	5100	0 %	0 %	50 %	50 %	295680430
156	NC_014119	TCG	2	6	5197	5202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295680430
157	NC_014119	ATG	2	6	5205	5210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295680430
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159	NC_014119	CCG	2	6	5248	5253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295680430
160	NC_014119	ATC	2	6	5268	5273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295680430
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163	NC_014119	GGT	2	6	5291	5296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295680430
164	NC_014119	GCC	2	6	5301	5306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295680430
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171	NC_014119	GCA	2	6	5588	5593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295680430
172	NC_014119	AAT	2	6	5600	5605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295680430
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175	NC_014119	GCA	2	6	5704	5709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295680430
176	NC_014119	GCATG	2	10	5732	5741	20 %	20 %	40 %	20 %	295680430
177	NC_014119	CGT	2	6	5963	5968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295680431
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252	NC_014119	GC	4	8	8819	8826	0 %	0 %	50 %	50 %	295680432
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260	NC_014119	CGTG	2	8	9044	9051	0 %	25 %	50 %	25 %	295680432
261	NC_014119	CGT	2	6	9080	9085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295680432
262	NC_014119	GCG	2	6	9124	9129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295680432
263	NC_014119	CG	3	6	9128	9133	0 %	0 %	50 %	50 %	295680432
264	NC_014119	TCG	2	6	9136	9141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295680432
265	NC_014119	CAG	2	6	9210	9215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295680432
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267	NC_014119	CG	3	6	9250	9255	0 %	0 %	50 %	50 %	295680432
268	NC_014119	CCG	2	6	9256	9261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295680432
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395	NC_014119	CGA	2	6	18784	18789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295680441
396	NC_014119	CG	3	6	18809	18814	0 %	0 %	50 %	50 %	295680441
397	NC_014119	GCG	2	6	18846	18851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295680441
398	NC_014119	CGA	2	6	18889	18894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295680441
399	NC_014119	TCG	2	6	18895	18900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295680441
400	NC_014119	GCC	2	6	18923	18928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295680441
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402	NC_014119	CGC	2	6	18998	19003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295680441
403	NC_014119	AGC	3	9	19005	19013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295680441
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415	NC_014119	GAT	2	6	19316	19321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295680441
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421	NC_014119	TCG	2	6	19465	19470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295680441
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423	NC_014119	GACC	2	8	19528	19535	25 %	0 %	25 %	50 %	295680441
424	NC_014119	GCCGAA	2	12	19589	19600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295680441
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429	NC_014119	CCG	2	6	19898	19903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295680442
430	NC_014119	CGC	3	9	19911	19919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295680442
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433	NC_014119	AGCGC	2	10	19953	19962	20 %	0 %	40 %	40 %	295680442
434	NC_014119	CGG	2	6	19974	19979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295680442
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438	NC_014119	GCCG	2	8	20122	20129	0 %	0 %	50 %	50 %	295680442
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440	NC_014119	GAT	2	6	20155	20160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295680442
441	NC_014119	CAC	2	6	20167	20172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	295680442
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443	NC_014119	GCC	2	6	20245	20250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295680442
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445	NC_014119	ACGA	2	8	20288	20295	50 %	0 %	25 %	25 %	295680442
446	NC_014119	ACG	2	6	20309	20314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295680442
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451	NC_014119	ACGA	2	8	20447	20454	50 %	0 %	25 %	25 %	295680442
452	NC_014119	TGA	2	6	20484	20489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295680442
453	NC_014119	AGC	2	6	20537	20542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295680442
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457	NC_014119	GC	3	6	20638	20643	0 %	0 %	50 %	50 %	295680442
458	NC_014119	GC	3	6	20680	20685	0 %	0 %	50 %	50 %	295680442
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463	NC_014119	AG	3	6	20751	20756	50 %	0 %	50 %	0 %	295680443
464	NC_014119	CGG	2	6	20771	20776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295680443
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466	NC_014119	GATA	2	8	20876	20883	50 %	25 %	25 %	0 %	295680443
467	NC_014119	CGC	2	6	20906	20911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295680443
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470	NC_014119	GCC	2	6	20985	20990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295680443
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474	NC_014119	GCC	2	6	21108	21113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295680443
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489	NC_014119	GCGCG	2	10	21572	21581	0 %	0 %	60 %	40 %	295680443
490	NC_014119	CGG	2	6	21605	21610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295680443
491	NC_014119	CGA	2	6	21624	21629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295680443
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494	NC_014119	CG	4	8	21683	21690	0 %	0 %	50 %	50 %	295680443
495	NC_014119	CCA	2	6	21695	21700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	295680443
496	NC_014119	CTG	2	6	21702	21707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295680443
497	NC_014119	CCGCGC	2	12	21814	21825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295680443
498	NC_014119	CG	4	8	21914	21921	0 %	0 %	50 %	50 %	295680443
499	NC_014119	CGT	2	6	21929	21934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295680443
500	NC_014119	GCG	2	6	21938	21943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295680443

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